35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3997 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  62.26 
 
 		 267 aa  360  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  58.49 
 
 		 266 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  38.89 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  36.48 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  34.22 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  32.82 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  46.05 
 
 		 160 aa  89  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  35.59 
 
 		 350 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  37.62 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  27.62 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  29.55 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  27.5 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  27.8 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  28.02 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  28.51 
 
 		 717 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  25.61 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  28.8 
 
 		 709 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  24.67 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  27.31 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  42.71 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  37.86 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  26.12 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  24.89 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  25.1 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  24.58 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  37.88 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  42.03 
 
 		 102 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  23.66 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  36.11 
 
 		 181 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  28.4 
 
 		 113 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  35.37 
 
 		 125 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>