38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2720 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1103    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  28.81 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  22.84 
 
 		 717 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  27.01 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  27.11 
 
 		 711 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  25.79 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  25.98 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  26.88 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  27.19 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  28.14 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  31.82 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  26.09 
 
 		 340 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  24.86 
 
 		 330 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  23.06 
 
 		 337 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  26.42 
 
 		 254 aa  54.3  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  26.09 
 
 		 340 aa  53.9  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  23.68 
 
 		 329 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  25.47 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.2 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  23.62 
 
 		 656 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  26.33 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  23.15 
 
 		 333 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  23.15 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  23.15 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  23.15 
 
 		 333 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  23.15 
 
 		 333 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  23.65 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  21.61 
 
 		 658 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  25 
 
 		 329 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  23.15 
 
 		 329 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  22.55 
 
 		 333 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  24.5 
 
 		 333 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  22.83 
 
 		 646 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  23.49 
 
 		 334 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  24.27 
 
 		 489 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  23.76 
 
 		 319 aa  43.5  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  25.33 
 
 		 316 aa  43.5  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  24.14 
 
 		 326 aa  43.5  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>