77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2301 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  72.14 
 
 		 711 aa  1094    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  100 
 
 		 709 aa  1442    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  62.55 
 
 		 717 aa  913    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  42.45 
 
 		 479 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  45.74 
 
 		 340 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  47.63 
 
 		 340 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  46.69 
 
 		 340 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  42.11 
 
 		 340 aa  244  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  46.33 
 
 		 329 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  43.59 
 
 		 330 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  45.31 
 
 		 343 aa  239  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  43.98 
 
 		 329 aa  237  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  42.22 
 
 		 330 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 337 aa  227  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  41.43 
 
 		 335 aa  226  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  46.82 
 
 		 254 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  41.18 
 
 		 252 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  44.17 
 
 		 181 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  29.38 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  29.05 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  30.08 
 
 		 265 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  23.84 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  21.88 
 
 		 2081 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  27.47 
 
 		 266 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  30.04 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  42.65 
 
 		 102 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  26.34 
 
 		 267 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.36 
 
 		 413 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  48.53 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  41.18 
 
 		 102 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  23.26 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  23.67 
 
 		 620 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  23.69 
 
 		 618 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  27.08 
 
 		 580 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  23.6 
 
 		 621 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 350 aa  55.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  34.88 
 
 		 126 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  37.1 
 
 		 199 aa  54.7  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  39.13 
 
 		 106 aa  54.3  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  22.4 
 
 		 1330 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  21.5 
 
 		 867 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  40.54 
 
 		 112 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  40.54 
 
 		 112 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  22.8 
 
 		 600 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  26.94 
 
 		 344 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  37.84 
 
 		 112 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  21.12 
 
 		 790 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  24.35 
 
 		 344 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  38.36 
 
 		 113 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  26.94 
 
 		 344 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25.31 
 
 		 426 aa  50.8  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  21.08 
 
 		 712 aa  50.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  23.91 
 
 		 347 aa  50.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  22.97 
 
 		 794 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  22.4 
 
 		 656 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  22.71 
 
 		 955 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  23.99 
 
 		 1525 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  22.74 
 
 		 958 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  20.96 
 
 		 1329 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.74 
 
 		 426 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  22.74 
 
 		 646 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  23.06 
 
 		 1645 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23 
 
 		 658 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.15 
 
 		 656 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  23.1 
 
 		 958 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  43.94 
 
 		 326 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  36 
 
 		 130 aa  44.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  21.82 
 
 		 1329 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  22.53 
 
 		 664 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  24.75 
 
 		 650 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  22.55 
 
 		 1017 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  27.48 
 
 		 655 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  27.95 
 
 		 245 aa  44.3  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>