60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2048 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  100 
 
 		 340 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  78.3 
 
 		 343 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  66.28 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  61.81 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  60.93 
 
 		 340 aa  427  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  54.12 
 
 		 335 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  48.12 
 
 		 717 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  46.42 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  44.77 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  44.06 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  45.86 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  42.11 
 
 		 709 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  42.77 
 
 		 479 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  45.48 
 
 		 711 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  42.86 
 
 		 254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  43.83 
 
 		 252 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  48.63 
 
 		 181 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  52.05 
 
 		 102 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  53.33 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  49.32 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  45.78 
 
 		 100 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  26.83 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  27.8 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  26.21 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  29.67 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  27.8 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  27.24 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  27.57 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  40.79 
 
 		 106 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  43.66 
 
 		 130 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  23.61 
 
 		 655 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  26.33 
 
 		 426 aa  53.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  39.47 
 
 		 160 aa  52.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  31.25 
 
 		 126 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  42.31 
 
 		 125 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  29.01 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  26.42 
 
 		 413 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  27.34 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  36.08 
 
 		 113 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  27.52 
 
 		 215 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  29.29 
 
 		 220 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  24.33 
 
 		 867 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  22.29 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  27.98 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  22.56 
 
 		 790 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 458 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  39.44 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  26.47 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  25.82 
 
 		 1496 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1110 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  25.62 
 
 		 658 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  39.44 
 
 		 112 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  36.67 
 
 		 199 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  25 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  25.11 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  25.38 
 
 		 219 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  25.38 
 
 		 219 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  38.03 
 
 		 112 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>