29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1237 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  100 
 
 		 247 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  49.59 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  47.56 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  39.75 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  26.26 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  26.26 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  27.01 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  26.3 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  24.58 
 
 		 184 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  41.03 
 
 		 545 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  28.87 
 
 		 302 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  24.55 
 
 		 1496 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  24.62 
 
 		 557 aa  45.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  24.71 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  43.84 
 
 		 556 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  36.11 
 
 		 514 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  25.91 
 
 		 655 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1110 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  25.57 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  48.89 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  23.58 
 
 		 841 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  25 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  24.28 
 
 		 806 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.69 
 
 		 413 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  25.45 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  31.34 
 
 		 340 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  29.46 
 
 		 160 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  36.71 
 
 		 555 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>