21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2831 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  25.4 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  28.42 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  26.26 
 
 		 259 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  28.96 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  30.32 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  27.03 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  41.33 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  25.41 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  26.26 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  43.4 
 
 		 90 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  42.59 
 
 		 90 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  34.78 
 
 		 538 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  43.75 
 
 		 89 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  34.62 
 
 		 92 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  25.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  31.91 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  47.92 
 
 		 90 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>