33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0291 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  44.46 
 
 		 897 aa  759    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  43.3 
 
 		 881 aa  721    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  100 
 
 		 841 aa  1746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  51.4 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  47.21 
 
 		 585 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  41.84 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  47.75 
 
 		 430 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  45.5 
 
 		 581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  36.43 
 
 		 589 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  42.12 
 
 		 643 aa  328  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  40.14 
 
 		 430 aa  296  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  30.18 
 
 		 499 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  29.17 
 
 		 455 aa  182  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  27.09 
 
 		 468 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  27.65 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  27.23 
 
 		 467 aa  171  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  27.29 
 
 		 473 aa  170  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  29.83 
 
 		 490 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  27.6 
 
 		 445 aa  159  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  26.75 
 
 		 470 aa  159  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  31.54 
 
 		 455 aa  158  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  25.58 
 
 		 493 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  28.02 
 
 		 459 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  25.94 
 
 		 543 aa  95.9  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  27.85 
 
 		 649 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  27.85 
 
 		 649 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  27.85 
 
 		 645 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  24.16 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  23.55 
 
 		 487 aa  60.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  27.23 
 
 		 1062 aa  56.6  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  23.08 
 
 		 443 aa  51.6  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.89 
 
 		 712 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  23.45 
 
 		 1158 aa  45.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>