17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3652 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  54.82 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  52.07 
 
 		 174 aa  177  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  49.7 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  34.33 
 
 		 555 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  33.08 
 
 		 556 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  30.6 
 
 		 545 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  30.6 
 
 		 557 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  30.28 
 
 		 538 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  27.88 
 
 		 326 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  28 
 
 		 514 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  33.61 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  34.88 
 
 		 128 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  31.25 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  25.45 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  27.94 
 
 		 656 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  29.2 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>