24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0653 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  100 
 
 		 555 aa  1148    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  52.81 
 
 		 545 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  50.09 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  44.47 
 
 		 557 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  40.98 
 
 		 514 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  37.43 
 
 		 538 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  40.69 
 
 		 326 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 225 aa  107  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  34.33 
 
 		 176 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  32.31 
 
 		 176 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0847  hypothetical protein  32.65 
 
 		 134 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00928688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  30.66 
 
 		 174 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  31.85 
 
 		 175 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  34.74 
 
 		 143 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  35.44 
 
 		 147 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  39.51 
 
 		 144 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  23.53 
 
 		 658 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  41.54 
 
 		 266 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  27.72 
 
 		 712 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1110 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  37.5 
 
 		 129 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  34.52 
 
 		 149 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  32.17 
 
 		 137 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  34.15 
 
 		 581 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>