31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2598 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  68.04 
 
 		 545 aa  778    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  100 
 
 		 556 aa  1136    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  50.09 
 
 		 555 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  47.13 
 
 		 557 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  41.55 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  40.77 
 
 		 538 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  42.37 
 
 		 326 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  30.35 
 
 		 225 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  33.08 
 
 		 176 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  26.96 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  36.09 
 
 		 176 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0847  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00928688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  26.32 
 
 		 650 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  32.31 
 
 		 175 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.95 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.23 
 
 		 413 aa  49.7  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25.45 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  26.67 
 
 		 362 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  35.48 
 
 		 128 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  31.63 
 
 		 266 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  26.71 
 
 		 658 aa  47  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  24.61 
 
 		 650 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  38.55 
 
 		 129 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  24.9 
 
 		 656 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  43.84 
 
 		 247 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  25.59 
 
 		 337 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  24.89 
 
 		 712 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  33.61 
 
 		 136 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  36.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  33.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>