19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0504 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  100 
 
 		 144 aa  299  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  81.12 
 
 		 143 aa  237  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  55.15 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  30.53 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  29.03 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  35.56 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  33.88 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  35.71 
 
 		 555 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  29.75 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  35.71 
 
 		 538 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  30.47 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  29.71 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  34.57 
 
 		 557 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  36.36 
 
 		 224 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  32.94 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1731  cytochrome c class III  35.48 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  34.21 
 
 		 545 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  27.97 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  27.73 
 
 		 514 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>