14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2013 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  100 
 
 		 128 aa  253  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  44.92 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  39.1 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  40 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  30.23 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  38.02 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  32.48 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  29.75 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2708  cytochrome c3  30.15 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  31.9 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  34.12 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  32.52 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  32.05 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  37.78 
 
 		 643 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>