17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2499 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  100 
 
 
130 aa  260  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  83.08 
 
 
129 aa  221  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  61.24 
 
 
130 aa  160  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  41.09 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  33.33 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  32.2 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2708  cytochrome c3  34.96 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  27.35 
 
 
147 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  28 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  35.29 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  35.71 
 
 
581 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  28.57 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  27.69 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  28 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  34.29 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  32 
 
 
314 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  34.15 
 
 
134 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>