27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1266 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  37.08 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  29.25 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  30.56 
 
 		 136 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1731  cytochrome c class III  32.41 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  35.09 
 
 		 514 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  30.71 
 
 		 326 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  34.12 
 
 		 147 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  36.47 
 
 		 545 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  42.86 
 
 		 538 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  31.34 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  30.23 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  36.17 
 
 		 643 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  35.11 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  32.38 
 
 		 126 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  31.78 
 
 		 134 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2708  cytochrome c3  37.66 
 
 		 136 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  33.68 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  35.48 
 
 		 581 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  32.81 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  36.36 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  32.26 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  36.36 
 
 		 144 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  36.14 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  29.5 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  33.72 
 
 		 128 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003115  cytochrome c-type protein nrfB precursor  33 
 
 		 200 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>