14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0215 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  79.23 
 
 		 130 aa  195  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  65.38 
 
 		 130 aa  167  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  44.92 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  34.19 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  34.29 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  26.32 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2708  cytochrome c3  34.21 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  27.64 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  32.94 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  35.56 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  33.33 
 
 		 581 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  26.61 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  28.21 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>