25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2420 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  44.85 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  38.1 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  36.63 
 
 		 581 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  31.39 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  36.81 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  34.19 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  32.71 
 
 		 643 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1731  cytochrome c class III  37.39 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  36.99 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  31.69 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  28.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  30.56 
 
 		 224 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  31.9 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  30.37 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  29.17 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  33.61 
 
 		 556 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  26.47 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  30.7 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  29.29 
 
 		 135 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  29.21 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  32.04 
 
 		 557 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  29.63 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  29.55 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  28 
 
 		 538 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>