13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2708 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2708  cytochrome c3  100 
 
 		 136 aa  283  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  35.71 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  30.15 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  30.88 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  32.12 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  29.92 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  37.66 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  24.48 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  31.03 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  27.91 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  27.91 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  30.53 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  26.77 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>