13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3182 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  65.38 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  59.2 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  39.1 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  36.81 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2708  cytochrome c3  36.84 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  29.82 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  30.66 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  28.06 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  33.33 
 
 		 581 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  30.95 
 
 		 143 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  28.57 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>