30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0760 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  100 
 
 		 581 aa  1194    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  51.25 
 
 		 643 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  44.22 
 
 		 897 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  45.03 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  45.1 
 
 		 881 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  45.5 
 
 		 841 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  42.73 
 
 		 589 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  26.93 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  28.19 
 
 		 649 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  27.98 
 
 		 649 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  28.1 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  24.54 
 
 		 578 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  35.92 
 
 		 136 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  41.38 
 
 		 133 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  21.86 
 
 		 969 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  36.36 
 
 		 142 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  24.68 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  36.84 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  32.71 
 
 		 151 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  33.7 
 
 		 134 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  26.79 
 
 		 1158 aa  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  35.71 
 
 		 130 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  34.51 
 
 		 128 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  34 
 
 		 113 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  33.33 
 
 		 129 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  34.83 
 
 		 147 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  33.33 
 
 		 130 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  22.86 
 
 		 1062 aa  44.3  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  32.14 
 
 		 557 aa  43.5  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  34.15 
 
 		 555 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>