28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0462 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  100 
 
 		 135 aa  280  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  36.72 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  38.54 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  36.46 
 
 		 581 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  35.96 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  30.67 
 
 		 538 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  37.04 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  36.19 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 329 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  34.58 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  32.69 
 
 		 330 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 330 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  29.7 
 
 		 276 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  32.46 
 
 		 329 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  29.9 
 
 		 643 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  36.36 
 
 		 557 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  34.57 
 
 		 545 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  30.08 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  29.29 
 
 		 254 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  31.01 
 
 		 717 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  32 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  29.29 
 
 		 136 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  36.25 
 
 		 556 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  28.71 
 
 		 337 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  33.71 
 
 		 555 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  26.71 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  27.18 
 
 		 335 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  30.48 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>