41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0454 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  54.54 
 
 		 881 aa  1011    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  100 
 
 		 897 aa  1874    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  44.46 
 
 		 841 aa  759    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  54.44 
 
 		 559 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  54.42 
 
 		 585 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  45.54 
 
 		 589 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  46.88 
 
 		 435 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  44.22 
 
 		 581 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  42.48 
 
 		 643 aa  357  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  41.67 
 
 		 430 aa  332  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  31.5 
 
 		 473 aa  210  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  31.43 
 
 		 455 aa  208  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  30.44 
 
 		 468 aa  201  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  30.43 
 
 		 499 aa  201  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  32.1 
 
 		 490 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  30.09 
 
 		 468 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  29.85 
 
 		 467 aa  188  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  30.1 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  28.88 
 
 		 470 aa  185  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  32.29 
 
 		 455 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  30.99 
 
 		 543 aa  172  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  28.35 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  31.74 
 
 		 578 aa  168  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  28.08 
 
 		 459 aa  162  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  28.4 
 
 		 649 aa  148  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  28.51 
 
 		 645 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  29.04 
 
 		 649 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  26.35 
 
 		 487 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  24.12 
 
 		 969 aa  91.3  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  26.2 
 
 		 1158 aa  56.2  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  25.59 
 
 		 1062 aa  53.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  26.92 
 
 		 577 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7914  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.73 
 
 		 461 aa  48.5  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1353  cytochrome oxidase,subunit I  26.5 
 
 		 367 aa  48.1  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0321  cytochrome oxidase,subunit I  26 
 
 		 367 aa  46.6  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.129729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1000  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.35 
 
 		 448 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0997  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.35 
 
 		 448 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.702896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0939  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  28.35 
 
 		 449 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0421  cytochrome c5530 family protein  38.33 
 
 		 1107 aa  44.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0800072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1068  hypothetical protein  38.37 
 
 		 158 aa  44.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.99319e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>