25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0759 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  100 
 
 		 430 aa  859    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  58.43 
 
 		 435 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 897 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  47.75 
 
 		 841 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  46.46 
 
 		 881 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  45.26 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  39.54 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  26.91 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  30.62 
 
 		 467 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  29.67 
 
 		 468 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  30.93 
 
 		 490 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  28.89 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  28.54 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  25.16 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  27.25 
 
 		 493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  27.85 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  27.82 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  28.44 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  45.59 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 589 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2709  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  26.98 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  26.46 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  23.37 
 
 		 457 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  24.34 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>