26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0717 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  100 
 
 		 455 aa  924    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  33.69 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  32.29 
 
 		 585 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  30.72 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 897 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  30.07 
 
 		 881 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  30.82 
 
 		 430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  28.13 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  29.17 
 
 		 841 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  28.82 
 
 		 445 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  31.12 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  25.16 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  28.51 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.4 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  26.03 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  26.13 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  26.04 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  24.37 
 
 		 468 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  25.81 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2910  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.78 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0552  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.09 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.343983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  24 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  24.23 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2709  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  24.12 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0477  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.305031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  31.13 
 
 		 259 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>