20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0543 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  100 
 
 		 445 aa  910    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  47.2 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  44.9 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  44.39 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  31.76 
 
 		 467 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  31.39 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  31.71 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  30.02 
 
 		 470 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  28.44 
 
 		 585 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  28.82 
 
 		 455 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  28.35 
 
 		 897 aa  169  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  27.6 
 
 		 841 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  26.5 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  27.44 
 
 		 881 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  27.98 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  26.36 
 
 		 430 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  25.75 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  22.75 
 
 		 490 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  22.43 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1639  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.89 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000461914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>