39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0368 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  100 
 
 		 459 aa  931    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  30.72 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  29.57 
 
 		 499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  29.55 
 
 		 585 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 881 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  28.08 
 
 		 897 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  30.66 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  31.24 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  28.02 
 
 		 841 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  28.05 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  27.71 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  26.68 
 
 		 467 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  25.61 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  28.27 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.06 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  24.12 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  22.43 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  26.46 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  25.7 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  26.42 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2709  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  24.29 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  24.06 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1168  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.28 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.89763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1146  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  29.28 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.628906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2910  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.32 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0552  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.4 
 
 		 449 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.343983  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0672  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  28.9 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3723  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  31.58 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5338  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  27.43 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5073  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  27.43 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4917  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  27.43 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5460  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  27.43 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5313  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  27.43 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13345e-23 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 559 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5615  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  26.58 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000237735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4905  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  27 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5344  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  26.58 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5395  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  27 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3760  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.73 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>