48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2567 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  100 
 
 		 448 aa  899    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  88.53 
 
 		 443 aa  745    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2709  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  72.12 
 
 		 441 aa  624  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2959  hypothetical protein  29.26 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.961915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2713  hypothetical protein  31.66 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  26.42 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.2 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1168  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.03 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.89763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1146  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.03 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.628906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3723  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.74 
 
 		 458 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3730  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.39 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.577823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  23.21 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3871  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.71 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  22.62 
 
 		 881 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.31 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.353174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1742  cytochrome d oxidase, subunit I  23.86 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0700  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.41 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.519317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.81 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  25.57 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1816  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.37 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.677362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2243  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.5 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0392435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0552  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.4 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.343983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1110  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.08 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  26.46 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0981  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.38 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1685  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  23.9 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.427643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3997  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.29 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000448397 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1695  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.71 
 
 		 459 aa  47  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.942682  hitchhiker  0.000141191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7914  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  23.94 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1639  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.26 
 
 		 462 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000461914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0118  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  23.62 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.166198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2910  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.64 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0259  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1686  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  27.1 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0523183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0254  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2473  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.77 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0475  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  24.18 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1294  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.26 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0889999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0579  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.85 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0136  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.17 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2688  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.28 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367978  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0172  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.11 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1505  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  23.32 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00635225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1393  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.13 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2590  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.27 
 
 		 481 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  23.98 
 
 		 490 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3204  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  20.72 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.123261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1674  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.87 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00374915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>