53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2709 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  72.12 
 
 		 448 aa  635    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2709  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  100 
 
 		 441 aa  887    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  69.59 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2713  hypothetical protein  31.67 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2959  hypothetical protein  28.6 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.961915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2243  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.79 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0392435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  27.92 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1168  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.38 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.89763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1146  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  26.38 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.628906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  24.29 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1742  cytochrome d oxidase, subunit I  21.99 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1110  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.11 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0552  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.1 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.343983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0981  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.53 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  26.34 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2910  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.39 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3723  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.23 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1685  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  23.83 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.427643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  25.98 
 
 		 881 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1816  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  21.38 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.677362  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  24.24 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0700  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  21.38 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.519317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7914  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  23.85 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3730  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.89 
 
 		 446 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.577823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  26.98 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1000  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.8 
 
 		 448 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0997  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.8 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.702896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0939  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.37 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.29 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.353174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0942  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.48 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0118  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  21.79 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.166198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0672  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  23.77 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3871  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.77 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1931  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.83 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.696481  normal  0.0492135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2473  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.61 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0560  cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1  22.73 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.550134  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1506  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  26.81 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1639  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  21.94 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000461914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2253  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.83 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2688  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.08 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367978  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01060  cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1  22.64 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0180484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1976  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.83 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00947535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13220  cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1  24.17 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0579  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.4 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0737  cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1  24.48 
 
 		 491 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2339  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  23.72 
 
 		 470 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342535  hitchhiker  0.0036305 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0136  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  21.78 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2482  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.72 
 
 		 470 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0475  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  20.65 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0350  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.27 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2267  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.19 
 
 		 499 aa  43.5  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1663  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  20.07 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.574234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4548  cytochrome bd ubiquinol oxidase (subunit I)  23.86 
 
 		 462 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.198321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>