More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0672 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0672  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  100 
 
 
451 aa  918    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1146  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  79.24 
 
 
453 aa  755    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.628906  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1168  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  79.24 
 
 
453 aa  755    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.89763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0552  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  54.81 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.343983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2910  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  53.51 
 
 
448 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0579  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  45.45 
 
 
449 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5073  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  42.67 
 
 
451 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4917  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  42.67 
 
 
451 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5460  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  42.67 
 
 
451 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5313  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  42.45 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13345e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5395  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  42.45 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4905  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  42.23 
 
 
451 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5615  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  41.58 
 
 
451 aa  326  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000237735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5338  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  42.23 
 
 
451 aa  325  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3760  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  42.86 
 
 
451 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5015  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  41.89 
 
 
451 aa  324  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5344  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  42.28 
 
 
451 aa  322  8e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2243  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.04 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0392435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1393  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.39 
 
 
442 aa  313  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2612  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.88 
 
 
439 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5647  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.8 
 
 
436 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.41115  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2016  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  40.37 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2203  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  40.84 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000111713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0981  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.67 
 
 
444 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00380609  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1110  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.19 
 
 
441 aa  292  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2688  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.93 
 
 
449 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3723  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.36 
 
 
458 aa  276  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6580  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  34.7 
 
 
521 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1000  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  38.02 
 
 
448 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0939  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  38.02 
 
 
449 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0997  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  37.78 
 
 
448 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.702896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7914  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  37.7 
 
 
461 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0256  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  35.43 
 
 
555 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0304  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  36.12 
 
 
493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3730  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  35.36 
 
 
446 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.577823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3871  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  35.36 
 
 
446 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  35.6 
 
 
446 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.353174  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000807  putative Cytochrome bd2 subunit I  33.26 
 
 
462 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3118  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  33.92 
 
 
480 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13030  CioA, cyanide insensitive terminal oxidase  32.88 
 
 
488 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2529  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  33.18 
 
 
471 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1177  cyanide insensitive terminal oxidase  32.65 
 
 
482 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2859  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  32.3 
 
 
466 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.664602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1448  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  31.47 
 
 
460 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1639  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.89 
 
 
462 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000461914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4893  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  33.19 
 
 
478 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.455192  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  33.33 
 
 
478 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4645  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  32.22 
 
 
478 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4651  ubiquinol oxidase subunit I, cyanide insensitive  32 
 
 
478 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4648  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  33.91 
 
 
479 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4513  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  32 
 
 
478 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.307129  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4282  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  34.16 
 
 
479 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586205  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3307  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  31.47 
 
 
535 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0119  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  30.32 
 
 
462 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000387  putative Cytochrome bd2 subunit I  33.03 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1250  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.4 
 
 
482 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4066  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.85 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.487615  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1615  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.93 
 
 
484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3386  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.22 
 
 
471 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0175  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.94 
 
 
470 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.770178  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0930  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  33.66 
 
 
444 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3573  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  33.66 
 
 
444 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0993209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3272  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  30.36 
 
 
473 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.967783  normal  0.83445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2644  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  32.44 
 
 
474 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1694  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.27 
 
 
497 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.199449  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5478  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.04 
 
 
470 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0727881  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4853  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  30.25 
 
 
470 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  0.189641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0092  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  32.61 
 
 
469 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5724  hypothetical protein  29.86 
 
 
462 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0914  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  33.17 
 
 
444 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5383  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.49 
 
 
559 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4791  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.82 
 
 
470 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1515  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  29.48 
 
 
507 aa  208  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0136  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  30.09 
 
 
434 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1976  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  31.29 
 
 
471 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00947535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2253  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  31.29 
 
 
471 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3759  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  30.29 
 
 
458 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3091  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  30.16 
 
 
444 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000134482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1640  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  29.87 
 
 
450 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.592672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0746  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.6 
 
 
479 aa  207  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265352  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0964  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.32 
 
 
446 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.694189  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1208  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  31 
 
 
448 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000278283  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6443  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.64 
 
 
466 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.470691 
 
 
-
 
NC_002978  WD0740  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  31.94 
 
 
468 aa  206  8e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5365  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.76 
 
 
473 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4818  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  29.76 
 
 
473 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6968  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.41 
 
 
466 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1268  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  31.26 
 
 
464 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4101  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.63 
 
 
483 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6552  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  30.63 
 
 
466 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1930  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  29.65 
 
 
450 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222762  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2163  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.35 
 
 
447 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000856883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0928  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.61 
 
 
446 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177592  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4570  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  30.65 
 
 
474 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1931  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  32.29 
 
 
471 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.696481  normal  0.0492135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11050  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.51 
 
 
476 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2095  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.56 
 
 
461 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0416  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  31.1 
 
 
468 aa  203  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5697  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  31 
 
 
467 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0516142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1472  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  30.37 
 
 
466 aa  203  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>