52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2955 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  100 
 
 		 443 aa  891    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  88.53 
 
 		 448 aa  764    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2709  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  69.59 
 
 		 441 aa  599  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2959  hypothetical protein  28.11 
 
 		 450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.961915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2713  hypothetical protein  29.86 
 
 		 437 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3723  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.8 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2243  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.81 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0392435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  24.06 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  26.62 
 
 		 881 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1168  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.38 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.89763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1146  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.38 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.628906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1742  cytochrome d oxidase, subunit I  25.38 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.31 
 
 		 585 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1110  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.1 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0560  cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1  24.24 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.550134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7914  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  24.41 
 
 		 461 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  25.99 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  24.23 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1393  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.4 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  24.73 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1686  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  26.95 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0523183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5647  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.41115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  23.08 
 
 		 841 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0552  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.4 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.343983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0981  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.64 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1931  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.696481  normal  0.0492135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0136  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  21.37 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1767  cytochrome oxidase d subunit I  26.19 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1976  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.51 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00947535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2253  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.51 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  24.34 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2910  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.6 
 
 		 448 aa  46.6  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1250  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.96 
 
 		 482 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3730  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  23.41 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.577823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2590  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.77 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4548  cytochrome bd ubiquinol oxidase (subunit I)  23.47 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1674  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  26.04 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00374915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0997  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.75 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.702896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3997  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.48 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000448397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0942  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.14 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0939  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  23.53 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2482  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.38 
 
 		 470 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2688  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.52 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1000  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.75 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3871  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.71 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2339  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  21.15 
 
 		 470 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342535  hitchhiker  0.0036305 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0175  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.52 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.332995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0672  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  22.88 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1294  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.44 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0889999  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0259  hypothetical protein  22.92 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0254  hypothetical protein  22.92 
 
 		 456 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.31 
 
 		 446 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.353174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>