22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0561 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  100 
 
 		 559 aa  1157    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  54.44 
 
 		 897 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  51.46 
 
 		 589 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  50.38 
 
 		 881 aa  528  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  41.84 
 
 		 841 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  45.12 
 
 		 643 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  45.03 
 
 		 581 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  31 
 
 		 543 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  30.21 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  29.81 
 
 		 649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  29.52 
 
 		 645 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  30.15 
 
 		 649 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  26.64 
 
 		 969 aa  94.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  23.09 
 
 		 487 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  45.59 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  25.42 
 
 		 1158 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  38.57 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  27.27 
 
 		 1062 aa  50.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  35.21 
 
 		 430 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  30.49 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2259  cytochrome c5530 family protein  34.29 
 
 		 1069 aa  43.9  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  39.39 
 
 		 459 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>