26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0274 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  100 
 
 		 589 aa  1222    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  51.46 
 
 		 559 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  49.63 
 
 		 881 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  45.54 
 
 		 897 aa  473  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  36.43 
 
 		 841 aa  336  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  40.86 
 
 		 643 aa  333  6e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  43.02 
 
 		 581 aa  332  9e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  29.47 
 
 		 543 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  29.73 
 
 		 578 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  28.36 
 
 		 649 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  28.51 
 
 		 645 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  28.25 
 
 		 649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  25.52 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  23.68 
 
 		 969 aa  77.8  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  38.16 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  29.52 
 
 		 1062 aa  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  40 
 
 		 1158 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  33.77 
 
 		 430 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  31.03 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0421  cytochrome c5530 family protein  40.3 
 
 		 1107 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0800072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  25.11 
 
 		 884 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  30.83 
 
 		 806 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25 
 
 		 757 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2259  cytochrome c5530 family protein  39.06 
 
 		 1069 aa  44.3  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  24.38 
 
 		 712 aa  43.9  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>