14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1703 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1020    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  26.35 
 
 		 897 aa  114  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  24.9 
 
 		 543 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  26.09 
 
 		 881 aa  91.3  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  26.67 
 
 		 578 aa  90.1  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  23.09 
 
 		 559 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  25.24 
 
 		 649 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  25.29 
 
 		 645 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  25.43 
 
 		 649 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  25.52 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  23.55 
 
 		 841 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  24.68 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  26.14 
 
 		 643 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  24.21 
 
 		 969 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>