24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5189 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  100 
 
 		 490 aa  992    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  33.8 
 
 		 585 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  32.79 
 
 		 897 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  30.6 
 
 		 881 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  30.16 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  30.12 
 
 		 841 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  30.37 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  30.77 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  25.62 
 
 		 455 aa  143  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  26.86 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  27.01 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  22.75 
 
 		 445 aa  136  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  25.65 
 
 		 468 aa  136  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  27.23 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  27.37 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  25.99 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  29.18 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  25.94 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  24.44 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  30.49 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3760  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.43 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1886  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.66 
 
 		 484 aa  43.9  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821372  normal  0.085717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5015  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.32 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  23.98 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>