21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0683 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  100 
 
 		 473 aa  957    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  63.87 
 
 		 493 aa  591  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  57.56 
 
 		 455 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  47.2 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  36.86 
 
 		 467 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  37.12 
 
 		 468 aa  261  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  35.22 
 
 		 470 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  35.42 
 
 		 468 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  30.97 
 
 		 585 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  31.5 
 
 		 897 aa  210  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  29.12 
 
 		 881 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  29.8 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  27.29 
 
 		 841 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  31.12 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  28.89 
 
 		 430 aa  153  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  26.25 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  27.97 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.99 
 
 		 490 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  24.12 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0350  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.62 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.51 
 
 		 318 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>