30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2651 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  100 
 
 		 113 aa  236  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  37.5 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  36.54 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  36.54 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  37 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  37.25 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  35.51 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  34.62 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  36.61 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  34.95 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  35.58 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  39.73 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  37.5 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  34 
 
 		 581 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  31.07 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  36.19 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  35.24 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  29.36 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  31.68 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  30.28 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  35.58 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  34.57 
 
 		 538 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  30.28 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  28.89 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  33.65 
 
 		 89 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  25.4 
 
 		 134 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  32.93 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  34.21 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  24.6 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>