25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0413 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  100 
 
 		 133 aa  279  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  44.85 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  32.33 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  41.38 
 
 		 581 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  29.82 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  29.73 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  37.96 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  26.32 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  32.48 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  29.25 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  28 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  36.26 
 
 		 643 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  33.73 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  34.88 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  32.12 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  30.51 
 
 		 545 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  40.38 
 
 		 514 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  28.37 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  32.94 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1731  cytochrome c class III  30.63 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  32 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  38.64 
 
 		 225 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  28.7 
 
 		 538 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  28.69 
 
 		 557 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  29.9 
 
 		 555 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>