22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0568 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  100 
 
 
514 aa  1064    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  40.98 
 
 
555 aa  425  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  42.49 
 
 
545 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  41.55 
 
 
556 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  37.74 
 
 
557 aa  322  7e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  34.12 
 
 
538 aa  309  9e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  34.85 
 
 
326 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  27.11 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  35.05 
 
 
224 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  40.91 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  23.88 
 
 
790 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  28 
 
 
176 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  23.7 
 
 
664 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  37.5 
 
 
259 aa  47  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  26.52 
 
 
480 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  36.11 
 
 
247 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  40.38 
 
 
133 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  32.06 
 
 
137 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  23.05 
 
 
777 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  23.05 
 
 
777 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  22.77 
 
 
650 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  23.84 
 
 
794 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>