18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1731 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1731  cytochrome c class III  100 
 
 		 134 aa  281  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  63.87 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  52.34 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  37.6 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  36 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  31.11 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  32.41 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  31.43 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  31.3 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  36.56 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  36.78 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  35.48 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  33.04 
 
 		 259 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  28.17 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  32.35 
 
 		 581 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  29.81 
 
 		 538 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2708  cytochrome c3  31.09 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  32.41 
 
 		 556 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>