30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2250 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  100 
 
 		 538 aa  1111    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  40.54 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  41.56 
 
 		 556 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  39.93 
 
 		 557 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  37.43 
 
 		 555 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  34.12 
 
 		 514 aa  309  9e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  34.3 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  34.76 
 
 		 225 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  40.28 
 
 		 147 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  30.67 
 
 		 135 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  34.83 
 
 		 128 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  30.28 
 
 		 176 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  32.81 
 
 		 174 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  32.08 
 
 		 126 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00928688  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  35.42 
 
 		 143 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  35.71 
 
 		 144 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  42.86 
 
 		 224 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  22.22 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  24.62 
 
 		 600 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.27 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.27 
 
 		 650 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  28.57 
 
 		 129 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  27.73 
 
 		 656 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  22.22 
 
 		 1009 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  27.27 
 
 		 142 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.38 
 
 		 757 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  21.89 
 
 		 656 aa  43.5  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>