30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2405 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  100 
 
 		 545 aa  1121    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  68.04 
 
 		 556 aa  748    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  52.81 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  45.99 
 
 		 557 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  42.49 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  40.54 
 
 		 538 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  39.66 
 
 		 326 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  32.48 
 
 		 225 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0847  hypothetical protein  27.46 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00928688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  33.1 
 
 		 176 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  25.27 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  24.48 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  30.6 
 
 		 176 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  40 
 
 		 129 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  31.85 
 
 		 175 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  31.3 
 
 		 174 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  25.1 
 
 		 331 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  41.03 
 
 		 247 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  24.11 
 
 		 453 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  36.47 
 
 		 224 aa  47  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  30.51 
 
 		 133 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  26.42 
 
 		 656 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  21.4 
 
 		 2222 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.65 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  34.57 
 
 		 135 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  36 
 
 		 128 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  23.55 
 
 		 658 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  25.33 
 
 		 442 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  36.59 
 
 		 149 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  25.09 
 
 		 307 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>