25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0558 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  54.79 
 
 		 144 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  50.7 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1731  cytochrome c class III  38.83 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  30.23 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  34.85 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  27.64 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  26.72 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  40.28 
 
 		 538 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  34.17 
 
 		 555 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  34 
 
 		 557 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  30.34 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  34.12 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  35.79 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  28.97 
 
 		 142 aa  47.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  34.88 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  30.37 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  34.83 
 
 		 581 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  31.68 
 
 		 514 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  36.84 
 
 		 643 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  26.71 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  38.46 
 
 		 545 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  26.67 
 
 		 689 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  27.52 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  23.85 
 
 		 130 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>