23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3004 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  38.1 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  31.58 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  36.36 
 
 		 581 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  36.52 
 
 		 643 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  29.73 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  38.02 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  36.17 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  35.96 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  30.66 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  26.92 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  35.56 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  28.97 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  27.27 
 
 		 538 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  30.71 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  32.8 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  33.33 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  28.06 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  28.08 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  32.17 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  37.04 
 
 		 514 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2708  cytochrome c3  24.14 
 
 		 136 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>