23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1961 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  40.08 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  39.84 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  32.02 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  34.06 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  41.54 
 
 		 555 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  40.91 
 
 		 514 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  27.83 
 
 		 656 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  23.33 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  31.76 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  31.63 
 
 		 556 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 658 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  25.22 
 
 		 557 aa  45.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  30.95 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  22.83 
 
 		 646 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  37.66 
 
 		 126 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  24.58 
 
 		 545 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  24.74 
 
 		 664 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  25.96 
 
 		 621 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  29.79 
 
 		 658 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0267  hypothetical protein  26.76 
 
 		 202 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000377506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  23.7 
 
 		 867 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>