15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4047 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  34.16 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  27.07 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0267  hypothetical protein  34.13 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000377506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  28.24 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  33.64 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  31.33 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  26.32 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  34.52 
 
 
555 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  36.59 
 
 
545 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  24.14 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  31.37 
 
 
557 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  28.83 
 
 
538 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  30.48 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  34.12 
 
 
556 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>