37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1027 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  50 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  46.83 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  43.55 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  42.61 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  36.72 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  36.17 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  29.37 
 
 		 225 aa  50.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  32.73 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  32.08 
 
 		 538 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  32.38 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  31.78 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  27.43 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  29.17 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  30.63 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  41.33 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  40.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  40.43 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  33.78 
 
 		 556 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  40.43 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  40.43 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  40.43 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  30.43 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  40 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  30.43 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  31 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  40 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  45.45 
 
 		 90 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  34.72 
 
 		 557 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  40.43 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  45.45 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  31.96 
 
 		 555 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  36.17 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  28.97 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  43.18 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>