24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2715 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  100 
 
 		 126 aa  261  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  58.06 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  46.83 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  54.31 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  44.53 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  31.11 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  33.64 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  26.92 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  28.23 
 
 		 225 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  32.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  41.77 
 
 		 557 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  30.63 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  30.63 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 266 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  29.17 
 
 		 514 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  31.36 
 
 		 90 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 224 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  29.23 
 
 		 538 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  25.41 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0267  hypothetical protein  25.89 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000377506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  32.98 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  34.51 
 
 		 545 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  40.48 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  37.11 
 
 		 247 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>