18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0679 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  357  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  91.95 
 
 		 174 aa  328  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  49.7 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  46.51 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  28.42 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  30.49 
 
 		 557 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  31.85 
 
 		 555 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  28.57 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  32.31 
 
 		 556 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  31.85 
 
 		 545 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  32.03 
 
 		 538 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  31.78 
 
 		 126 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0267  hypothetical protein  29.77 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000377506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  28.97 
 
 		 514 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  27.45 
 
 		 128 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0527  hypothetical protein  29.9 
 
 		 619 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  30 
 
 		 224 aa  41.2  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  26.14 
 
 		 129 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>