15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0666 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  358  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  91.95 
 
 		 175 aa  328  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  52.07 
 
 		 176 aa  177  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  47.85 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  30.66 
 
 		 555 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  28.96 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  31.06 
 
 		 557 aa  50.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  32.81 
 
 		 538 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  32.73 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  31.3 
 
 		 545 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  28.14 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  30.77 
 
 		 556 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  30.23 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0267  hypothetical protein  32.74 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000377506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  29.37 
 
 		 514 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>