54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0592 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  100 
 
 		 329 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  77.58 
 
 		 329 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  53.58 
 
 		 479 aa  345  8e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  51.51 
 
 		 330 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  50.76 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  49.85 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  50.32 
 
 		 717 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  53.91 
 
 		 254 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  46.09 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  47.34 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  46.38 
 
 		 340 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  45.03 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  46.62 
 
 		 711 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  46.33 
 
 		 709 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  44.02 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  47.11 
 
 		 252 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  43.72 
 
 		 181 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  52 
 
 		 102 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  52.31 
 
 		 100 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  31.48 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  27.39 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  21.57 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  37.23 
 
 		 102 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  26.99 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  26.51 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  37.23 
 
 		 102 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  37.86 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  26.05 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  34.29 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  37.61 
 
 		 126 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  26.05 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  31 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  27.96 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  41.89 
 
 		 113 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  43.84 
 
 		 112 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  33.77 
 
 		 125 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  33.77 
 
 		 106 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  37.8 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  35.29 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  36.62 
 
 		 135 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  38.16 
 
 		 160 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  27.16 
 
 		 211 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  30.88 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  22.67 
 
 		 712 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  25.57 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  31.52 
 
 		 580 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  27.39 
 
 		 266 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  26.2 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  21.9 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>