54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2930 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  100 
 
 		 329 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  77.58 
 
 		 329 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  52 
 
 		 479 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  53.31 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  52.57 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  49.56 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  50.79 
 
 		 717 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  50.29 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  50 
 
 		 340 aa  269  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  48.6 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  46.51 
 
 		 340 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  54.3 
 
 		 254 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  48.4 
 
 		 711 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  45.86 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  47.69 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  45.08 
 
 		 709 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  47.93 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  46.86 
 
 		 181 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  56.06 
 
 		 102 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  31.94 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  50.77 
 
 		 100 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  30.36 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  29.34 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  28.02 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  41.18 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  28.14 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  41 
 
 		 102 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  27.41 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  26.9 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  26.9 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  44.3 
 
 		 126 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  49.3 
 
 		 113 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  47.22 
 
 		 112 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  33.77 
 
 		 125 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  43.06 
 
 		 112 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  38.57 
 
 		 160 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  38.36 
 
 		 199 aa  49.3  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  24.4 
 
 		 580 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  23.32 
 
 		 655 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  32.46 
 
 		 135 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  24.89 
 
 		 347 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  24.52 
 
 		 793 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  24.09 
 
 		 867 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  24.71 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  26.35 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  27.22 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  24.48 
 
 		 458 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  26.33 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  36.76 
 
 		 130 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>